Игумен Фома (Василенко) родился в городе Волжское Волгоградской области в семье рабочих. При рождении был назван Александром. С детства увлекался футболом и играл в городской команде «Шинник». После окончания средней школы учился в техникуме на электромонтера. Проходил срочную службу в рядах Советской армии на советско-турецкой границе. Во время службы приобрел профессию повара. После армии работал в школе лаборантом, в милиции и на Волжских предприятиях.
Хотя родители были крещеными, но Александр крестился в зрелом возрасте в 1996. Стал посещать местный храм. В том же году отправился трудником в Дивеевский монастырь, а после — в Пайгармский женский монастырь в Мордовии, который только возрождался после советской эпохи. Через год принял монашество и священный сан. Был назначен духовником этого монастыря, где прослужил 7 лет.
В 2004 отец Фома был переведен в Иоанно-Богословский кафедральный собор в городе Саранске, а после окончания строительства нового собора в честь праведного Феодора Ушакова, был назначен его ключарем.
В 2014 принят в клир Санкт-Петербургской епархии и зачислен в число братии Александро-Невской Лавры. В том же году назначен настоятелем храма Тихвинской иконы Божией Матери при резиденция петербургских митрополитов на Каменном острове, а также новопостроенного храма благоверного великого князя Димитрия Донского при Университете Министерства внутренних дел Российской Федерации в Санкт-Петербурге.
До принятия монашества был женат. Имеет дочь.